overlapパッケージを使ってみた

先週で講義が終了しているので学内は静か。年末にネットワークの更新作業などが予定されているので、学生部屋のPCのWindowsの更新作業。3年生用のPCはあまり起動させていなかったので、更新がたまっている。その後、去年の卒論前にインストールしたRを3.5.2から3.6.2にバージョンアップ。共用PCはバージョンアップしてあったけど、残りのPCでも解析できるように対応させておく。プリンターのトナーは交換してあるし、年末年始に不具合があっても乗り切れるだろう。

今年こそは卒論の自動撮影データで果実食動物の訪問時間帯も真面目に解析したいので、気になっていたoverlapパッケージを使ってみる。チュートリアルを読みながら、手元にあったキカラスウリの訪花昆虫データで解析。もともとはトラとイノシシなどの活動時間の重なり具合を調べるために使われている手法なので、サンプルデータもスマトラのクリンチ山のデータ。とりあえず元データのファイル構造に合わせて、データを作成。時刻データは0から1に変換しておいて、ラジアンにして解析するらしい。しばらく動かしてみて活動時間を示したグラフと重複を示すグラフは描けるようになったので、元ファイルとRコードと作成したグラフをまとめて学生たちに送付。あとは自分のデータを使って工夫して頂戴。





夕方に2017年の卒論を石川県立自然誌資料館の研究報告に投稿していたハナグモとカタツムリの校正ファイルがようやく届いた。卒業生たちにクリスマスプレゼントならぬ校正ファイルを送付して、確認してもらう。一応、2019年12月発行になるようなので、しっかり確認。でも久しぶりに読むといろいろとミスが残っていたことに気が付く。

帰宅際に夕食を買いに出かけたところ、スターフルーツが販売されていた。全く売れる気配がなさそうだったので、1つ購入。税込み465円なので、結構高い。そもそもタイにいるときもあまり買ったりはしない果物なので、ちと不安だったけど、よく熟していた果実を選んで購入。さっぱりした甘さでおいしかった。